Ponad 300 prac, renomowane czasopisma z listy filadelfilskiej, czasopisma polskie i zagraniczne, czasopisma popularnonaukowe, publikacje on-line (wybrane):
Artur Pupka, Łukasz Grass: Koronawirus i trening sportowy. Med. Dypl. 2020 nr 5; s.56-58.
Artur Pupka, Dominika Pupka, Julita Sikora: Zmiany naczyniowe : codziennie zdajesz egzamin z medycyny. Med.Dypl. 2019 Vol.28 nr 7-8; s.106-107.
Artur Pupka.: Ekstremalny wysiłek fizyczny: markery i problemy kardiologiczne. Lek w Polsce 2015 Vol.25 nr 11-12; s.74-76.
Artur Pupka.: Przewlekła niewydolność żylna: etiopatogeneza, diagnostyka i leczenie. Chir.Dypl. 2015 T.10 nr 5; s.6-10, 12-16
Artur Pupka.: Aktywność fizyczna w przewlekłej niewydolności żylnej. W:Medycyna sportowa. Cz.2 ; pod red. Krzysztofa Klukowskiego; Warszawa : Medical Tribune Polska, 2012; s.120-124.
Artur Pupka, Jan Skóra, Dariusz Janczak, Tomasz Płonek, Jakub Marczak, Tomasz Szydełko.: In situ revascularisation with silver-coated polyester prostheses and arterial homografts in patients with aortic graft infection – a prospective, comparative, single-centre study Eur.J.Vasc.Endovasc.Surg. 2011 Vol.41 no.1; s.61-67.
Pupka A, Skóra J, Płonek T.: Response to comment regarding „Immunosuppression Following Fresh Arterial Homograft Implantation for Aortic Graft Infections”. Eur J Vasc Endovasc Surg. 2011 Vol.41; s.859-860.
Pupka A, Dolińska-Krajewska B, Barć P, Skóra J, Szyber P: The morphological evaluation of the homograft wall in an electron microscopic study. Folia Morphol 2003, 62, 4, 423-425.
Pupka A, Skóra J, Kałuża G, Chudoba P, Szyber P: A modification of the treatment of prosthetic graft infection complicating an aorto-duodenal fistula. Eur J Vasc Endovasc Surg Extra 2004, 7, 57-60.
Pupka A, Skóra J, Kałuża G, Szyber P: Surgical treatment of local prosthetic graft infection with fresh arterial homograft graft: report of four cases. EJVS Extra 2004, 7, 81-83.
Pupka A, Dorobisz AT, Stępiński P, Skóra J, Janczak D, Pawłowski S, Ruciński A, Szyber P: Własna modyfikacja leczenia operacyjnego przetok aortalno-dwunastniczych w porównaniu z innymi metodami operacyjnymi. Acta Angiol 2003, 9, 4, 183-190.
Artur Pupka, Tomasz Płonek, Krzysztof Lewicki, Jakub Maroszyk.: Influence of physical activity on the health condition of people after organ transplantation Med.Sport.(Kraków) 2008 Vol.12 nr 4; s.142-145.
Pupka A, Skóra J, Kałuża G, Szyber P: The detection of Chlamydia pneumoniae in ameurysm of abdominal aorta and in normal aortic wall of organ donors. Folia Microbiol 2004, 49, 1, 79-82.
Pupka A, Garcarek J, Kałuża G, Karasek M, Szyber P: Własna modyfikacja w diagnostyce arteriograficznej ucisku tętnicy podobojczykowej w obszarze górnego otworu klatki piersiowej. Pol J Radiol 2003, 68, 3, 51-55.
Artur Pupka, Artur Ruciński, Zbigniew Rybak, Krzysztof Korta, Sylwia Zacharska, Piotr Szyber.: Leczenie chirurgiczne zespołu uciskowego górnego otworu klatki piersiowej Przegl.Lek. 2006 T.63 nr 4; s.179-184.